L'histoire nous amène deux ans après la fin de la série alors qu'Edward Elric, âgé de dix-huit ans, est toujours bloqué dans l'autre monde derrière la porte, ce qui le replonge dans l'Allemagne de l'entre‑deux‑guerres. Notre jeune alchimiste national fait des recherches en fuséologie avec son nouveau partenaire, Alfons Heiderich, pour réaliser son rêve : revenir un jour dans son monde et retrouver son frère ! Malheureusement, tous ses efforts tombent à l'eau. Ed sera‑t‑il bloqué à jamais dans ce monde ou trouvera‑t‑il un moyen de concrétiser son rêve ?