L'histoire se déroule 2 ans après la première saison, tous les habitants de l'île d'Hatsune Jima vivent désormais paisiblement... 
jusqu'à l'arrivée d'une jeune fille, qui cherche à apprendre la magie auprès de la grand mère Yoshino. (La grand mère de Sakura) 
C'est alors que l'on commence à découvrir ce qui s'est déroulé depuis deux ans...

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