L'Enfer a été envahi et le Mur des lamentations a été détruit. La route est maintenant ouverte pour que nos héros puissent voyager à travers les dimensions afin de se rendre au champ de bataille final : la plaine divine d'Elysion. Là ou se trouve la forme réelle et véritable d'Hadès, intact, invisible depuis tant de siècles. Seiya et ses compagnons ont maintenant un seul objectif en tête, qui est le retour de l'armure sainte de la déesse Athéna, de sorte qu'elle puisse détruire Hadès une fois pour toutes.
Les Saints devront d'abord affronter les puissants gardiens d'Elysion : Thanatos, le dieu de la Mort, et son frère jumeau Hypnos, le dieu du Sommeil.

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Nous retrouvons à nouveau Seiya et ses quatre compagnons, dans le royaume d'Hadès où nous avions laissé Kanon et Ikki en plein combat contre les trois juges des Enfers (Minos, Eaque et Radamanthe).

Nos cinq héros auront un parcours semé d'embûches au travers du Cocyte jusqu'à la salle du trône d'Hadès, dans laquelle le combat final se prépare déjà.

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